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| Nom latin | Nom français | |
| Aconitum corsicum Gayer | Aconit de Corse. | Liste 1 |
| Adonis pyrenaica DC. | Adonis des Pyrénées. | Liste 1 |
| Adonis vernalis L. | Grand oeil de boeuf, Adonis printanier. | Liste 2 |
| Agrostis tenerrima Trin. | Agrostis élégant. | Liste 1 |
| Aldrovanda vesiculosa L. | Aldrovanda. | Liste 1 |
| Alisma graminifolia Ehrh. | Fluteau à feuilles de graminées. | Liste 2 |
| Allium chamaemoly L. | Ail petit Moly. | Liste 1 |
| Allium lineare Schrader. | Ail dressé. | Liste 1 |
| Allium moly L. | Ail doré. | Liste 1 |
| Althenia barrandonii Duval-Jouve. | Althenie. | Liste 1 |
| Alyssum arenarium Loisel | Corbeille d'or des sables. | Liste 1 |
| Alyssum corsicum Duby | Corbeille d'or de Corse. | Liste 1 |
| Ambrosiania bassii L. | Ambrosiania de Bassi. | Liste 1 |
| Ampelodesmos mauretanica (Poiret) T. Durand et Schinz | ? | Liste 1 |
| Anagallis crassifloria Thore | Mouron à feuilles charnues | Liste 1 |
| Anchusa crispa Viv. | Buglosse crépu. | Liste 1 |
| Andromeda polifolia L. | Andromède. | Liste 1 |
| Androsace alpina (L.) Lam. | Androsace des Alpes. | Liste 1 |
| Androsace chamaejasme Wulfen | Androsace petit-jasmin. | Liste 1 |
| Androsace cylindrica DC. | Androsace cylindrique. | Liste 1 |
| Androsace helvetica (L.) All. | Androsace de Suisse. | Liste 1 |
| Androsace pubescens DC. | Androsace pubescente. | Liste 1 |
| Androsace pyrenaica Lam. | Androsace des Pyrénées. | Liste 1 |
| Androsace vandellii (Turra) Chiov. | Androsace de Vandelli. | Liste 1 |
| Anemone coronaria L. | Anémome couronnée. | Liste 1 |
| Anemone palmata L. | Anémone palmée. | Liste 1 |
| Anemone sylvestris L. | Anémone sauvage. | Liste 1 |
| Anemone trifolia L. | Anémone trifoliée. | Liste 1 |
| Angelica heterocarpa Lloyd. | Angélique à fruits variés. | Liste 1 |
| Anthyllis barba-jovis L. | Arbuste d'argent, Barbe de Jupiter. | Liste 1 |
| Apium repens (Jacq.) Lag. | Ache rampante. | Liste 1 |
| Aquilegia alpina L. | Ancolie des Alpes. | Liste 1 |
| Aquilegia bertolonii Schott | Ancolie de Bertolini. | Liste 1 |
| Aquilegia viscosa Gouan. | Ancolie des Causses. | Liste 1 |
| Arenaria controversa Boiss. | Sabline des chaumes. | Liste 1 |
| Arenaria provencialis Chater et Halli day. | Sabline de Provence. | Liste 1 |
| Armeria elongata L. | Armeria à tige allongée. | Liste 1 |
| Armeria filicaulis belgenciensis Boiss. | Armeria de Belgentier. | Liste 1 |
| Armeria maritima micella (Miller) Willd. | Oeillet marin, Gazon d'Espagne. | Liste 1 |
| Armeria pubinervis Boiss. | Armeria à nervures poilues. | Liste 1 |
| Armeria pungens (Link) Hoffmans et Link. | Armeria piquant. | Liste 1 |
| Armeria ruscinonensis Girard. | Armeria du Roussillon. | Liste 1 |
| Armeria soleirolii (Duby) Godron. | Armeria de Soleirol. | Liste 1 |
| Artemisia insipida Vill. | Armoise insipide. | Liste 1 |
| Asperula hexaphylla All. | Asperule à feuilles par six. | Liste 1 |
| Asperula occidentalis Rouy. | Asperule occidentale. | Liste 1 |
| Asperula taurina L. | Grande Croisette. | Liste 1 |
| Asphodelus arrondeaui Lloyd. | Bâton blanc d'Arrondeau. | Liste 2 |
| Aster amellus L. | Marguerite de la Saint-Michel. | Liste 1 |
| Aster pyrenaeus Desf. ex DC. | Aster des Pyrénées. | Liste 1 |
| Astragalus bayonnensis Loisel. | Astragale de Bayonne. | Liste 1 |
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Astragalus
centralpinus Br.-Bl. = Astragalus alopecurus Pall. |
Queue-de-renard des Alpes. | Liste 1 |
| Astragalus leontinus Wulfen. | Astragale de Lenzbourg. | Liste 1 |
| Astragalus massiliensis (Mill.) Lam. = Astragalus tragacantha L. | Astragale de Marseille | Liste 1 |
| Astragalus alopecuroides L. | Queue-de-renard d'Espagne. | Liste 1 |
| Atractylis cancellata L. | Atractyle grillagé. | Liste 1 |
| Atriplex longipes Drejer | Arroche à long pédoncule. | Liste 1 |
| Bartsia spicata Ramond. | Bartsie en épi. | Liste 1 |
| Bellevalia romana (L.) Reichenb. | Bellevalia de Rome | Liste 1 |
| Bellevalia trifoliata (Ten.) Kunth. | Bellevalia à trois feuilles. | Liste 1 |
| Berardia subacaulis Vill. | Chardon de Bérard, Berarda. | Liste 1 |
| Betula nana L. | Bouleau nain. | Liste 1 |
| Biscutella neustriaca Bonnet | Lunetière de Neustrie. | Liste 1 |
| Borderea pyrenaica Miegeville. | Dioscorée des Pyrénées. | Liste 1 |
| Brassica insularis Moris. | Choux de Corse. | Liste 1 |
| Bromus bromoideus (Lej. Crepin). | Brome des Ardennes. | Liste 1 |
| Bromus grossus Desf. ex DC. | Brome à fleurs nombreuses. | Liste 1 |
| Buglossoides gastonii (Bentham) 1. M. Johnston. | Gremil du Béarn, G. de Gaston. | Liste 1 |
| Caldesia parnassifolia (L.) Parl. | Alisma (Fluteau) à feuilles de Parnassie. | Liste 1 |
| Calla palustris L. | Arum d'eau, Choucelle. | Liste 1 |
| Campanula cervicaria L. | Campanule cervicaire | Liste 1 |
| Cardamine chelidonia L. | Cardamine fausse Chélidoine. | Liste 1 |
| Carex atrofusca Schkuhr. | Laîche noirâtre. | Liste 1 |
| Carex bicolor All. | Laîche bicolore. | Liste 1 |
| Carex buxbaumii Wahlenb. | Laîche de Buxbaum | Liste 1 |
| Carex chordorrhiza L. fil. | Laîche à long rhizome. | Liste 1 |
| Carex firma Host. | Laîche rigide. | Liste 1 |
| Carex fritschii Waisb. | Laîche de Fritsch. | Liste 1 |
| Carex glacialis Mack. | Laîche des glaciers | Liste 1 |
| Carex grioletii Roemer. | Laîche de Griolet. | Liste 1 |
| Carex heleonastes L. fil. | Étoile des marais. | Liste 1 |
| Carex hordeistichos Vill. | Laîche à épis d'orge. | Liste 1 |
| Carex irrigua Hiitonen. | Laîche inondable des tourbières. | Liste 1 |
| Carex limosa L. | Laîche des tourbières, Laiche des vases. | Liste 1 |
| Carex migroglochin Wahlenb. | Laîche à petite arète. | Liste 1 |
| Carex ornithopodioides Hausm. | Laîche faux-Pied d'oiseau. | Liste 1 |
| Carex pseudobrizoides Clavaud. | Laîche fausse-brize. | Liste 1 |
| Carex reichenbachii Bonnet | Laîche de Reichenbach. | Liste 1 |
| Carex repens Bellardi | Laîche rampante. | Liste 1 |
| Carex vaginata Tausch. | Laîche à feuille engainante. | Liste 1 |
| Centaurea corymbosa Pourret. | Centaurée en corymbe, C. de la Clape. | Liste 1 |
| Centaurea pseudocoerulescens Briquet. | Fausse Centaurée bleuâtre | Liste 1 |
| Centaurium capitatum Melderis. | Petite centaurée à fleurs en tête. | Liste 2 |
| Centaurium chloodes (Brot.) Sampaio. | Petite Centaurée à fleurs serrées. | Liste 1 |
| Centaurium scilloides (L. Fil) Sampiao. | Petite Centaurée à fleurs de scille. | Liste 1 |
| Centranthus trinervis (Viv.) Beguinot | Centranthe à trois nervures. | Liste 1 |
| Cephalaria syriaca (L.) Roem et Schultes. | Cephalaire de Syrie. | Liste 1 |
| Ceratonia siliqua L. | Caroubier. | Liste 2 |
| Cerinthe glabra tenuiflora (Bertol.) Domac. | Melinet des Alpes. | Liste 1 |
| Chamaecytisus glaber (L. fil.) Rothmal. | Cytise à longues grappes. | Liste 1 |
| Chamaerops humilis L. | Palmier nain, Doum. | Liste 1 |
| Charybdis maritima (L.) Speta = Urginea maritima (L.) Baker | Scille officinale, Scille maritime | Liste 2 |
| Charybdis undulata (Desf.) Speta | Scille à feuilles ondulées | Liste 1 |
| Cirsium alsophilum (Pollini) Soldano = Cirsium montanum auct. | Cirse d'Allioni, Cirse des montagnes | Liste 1 |
| Cistus populifolius L. | Ciste à feuilles de peuplier | Liste 1 |
| Cistus pouzolzii Delile | Ciste de Pouzolz | Liste 1 |
| Cistus psilocephalus Sweet. | Ciste hérissé. | Liste 1 |
| Cochlearia aestuaria (Lloyd) Heywood. | Cranson des estuaires. | Liste 1 |
| Colchicum corsicum Baker | Colchique de Corse. | Liste 1 |
| Colchicum cupanii Guss. | Colchique de Bertoloni. | Liste 1 |
| Coleanthus subtilis Seidl. | Coléanthe délicat. | Liste 1 |
| Cortusa matthiolii L. | Cortuse de Matthioli. | Liste 1 |
| Crambe maritima L. | Chou marin, | Liste 1 |
| Crepis rhaetica Hegetschw. | Crepis des Alpes réthiques. | Liste 1 |
| Cypripedium calceolus L. | Sabot-de-Vénus. | Liste 1 |
| Cytisus ardoinoi E. Fourn. | Cytise d'Ardoino. | Liste 1 |
| Daboecia cantabrica (Hudson) C. Koch. | Bruyère de Saint-Daboec. | Liste 1 |
| Damasonium alisma Miller. | Étoile d'eau. | Liste 1 |
| Damasonium polyspermum Cosson. | Étoile d'eau à nombreuses graines. | Liste 1 |
| Daphne striata Tratt. | Camélée striée | Liste 1 |
| Daucus gadeceaui Rouy et Camus. | Carotte de Gadeceau. | Liste 1 |
| Delphinium requienii DC. | Dauphinelle de Requien. | Liste 1 |
| Delphinium staphysagria L. | Staphysaigre, Herbe aux poux. | Liste 2 |
| Delphinium verdunense Balbis. | Pied-d'alouette de Bresse. | Liste 1 |
| Dianthus gallicus Pers. | Oeillet de France, Oeillet des dunes. | Liste 1 |
| Dianthus superbus L. | Oeillet magnifique. | Liste 2 |
| Draba incana L. | Drave blanchâtre. | Liste 1 |
| Dracocephalum austriacum L. | Dracocéphale d'Autriche. | Liste 1 |
| Drosera anglica Hudson | Rossolis à feuilles longues. | Liste 2 |
| Drosera intermedia Hayne | Rossolis intermédiaire. | Liste 2 |
| Drosera rotundifolia L. | Rossolis à feuilles rondes. | Liste 2 |
| Echinospartum horridum (Vahl) Rothm. | Genêt très épineux. | Liste 1 |
| Elatine brochonii Clavaud. | Elatine de Brochon. | Liste 1 |
| Epipogon aphyllum Swartz. | Epipogon sans feuilles. | Liste 1 |
| Erica lusitanica Rudolphi. | Bruyère du Portugal. | Liste 1 |
| Erica erigena R. Ross. | Bruyère de la Méditerranée. | Liste 1 |
| Erinacea anthyllis Lmk. | Cytise hérisson. | Liste 1 |
| Eriophorum gracile Koch ex Roth. | Linaigrette grêle. | Liste 1 |
| Erodium manescavii Cosson. | Erodium (Bec de grue) de Manescot. | Liste 1 |
| Erodium rodiei (Br.-BI.) Poirion. | Erodium de Rhodié. | Liste 1 |
| Eryngium alpinum L. | Panicaut des Alpes, Étoile des Alpes. | Liste 1 |
| Eryngium barrelieri Boiss. | Panicaut nain de Barrelier. | Liste 1 |
| Eryngium spinalba Vill. | Panicaut blanc des Alpes, Chardon blanc. | Liste 1 |
| Eryngium viviparum Gay. | Panicaut nain vivipare. | Liste 1 |
| Euphorbia graminifolia Vill. | Euphorbe à feuilles de graminées. | Liste 1 |
| Euphorbia peplis L. | Euphorbe Peplis. | Liste 2 |
| Euphorbia variabilis Cesati. | Euphorbe variable. | Liste 1 |
| Evax carpetana Lange. | Evax de Cavanillès. | Liste 1 |
| Evax rotundata Moris. = Filago tyrrhenica Chrtek & Holub | Evax de Corse | Liste 1 |
| Fritillaria montana Hoppe = Fritillaria orientalis Adams | Fritillaire de Caussols | Liste 1 |
| Gagea foliosa (J. et C. Prest.) Schultes | Gagée très feuillue. | Liste 1 |
| Gagea granatelli (Parl.) Parl. | Gagée de Granatelli. | Liste 1 |
| Gagea lutea (L.) Ker-Gawler | Gagée jaune. | Liste 1 |
| Gagea minima (L.) Ker-Gawler | Petite gagée. | Liste 1 |
| Gagea pratensis (Pers.) Dumort. | Gagée des prés. | Liste 1 |
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Gagea
saxatilis (Mert. et Koch) Schultes = Gagea bohemica subsp. saxatilis |
Gagée des rochers. | Liste 1 |
| Gagea soleirolii F.W. Schultz | Gagée de Soleirol. | Liste 1 |
| Gagea spathacea (Hayne) Salisb. | Gagée à spathe. | Liste 1 |
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Gagea
villosa
(M.Bieb.) Sweet = Gagea arvensis (Pers.) Dum. |
Gagée des champs, Gagée velue | Liste 1 |
| Gallium trifidum L. | Gaillet trifide. | Liste 1 |
| Garidella nigellastrum L. | Garidelle fausse-nigelle. | Liste 1 |
| Genista linifolia L. | Genêt à feuilles de lin | Liste 1 |
| Gentiana ligustica R. de Vilm. & Chopinet | Gentiane ligure. | Liste 1 |
| Gentiana utriculosa L. | Gentianelle à calice renflé. | Liste 1 |
| Gentianella amarella Börner. | Gentianelle amère. | Liste 1 |
| Gentianella uliginosa Börner. | Gentianelle des marais. | Liste 1 |
| Geranium argenteum L. | Géranium à feuilles argentées. | Liste 1 |
| Geranium cinereum Cav. | Géranium à feuilles cendrées. | Liste 1 |
| Geranium endressii Gay. | Géranium d'Endress. | Liste 1 |
| Geum heterocarpum Boiss. | Benoîte à fruits divers. | Liste 1 |
| Gladiolus dubius Guss. | Glaïeul douteux. | Liste 1 |
| Gladiolus palustris Gaudin. | Glaïeul des marais. | Liste 1 |
| Gratiola officinalis L. | Gratiole officinale. | Liste 2 |
| Halimione pedunculata Aellen | Obione à fruit pédonculé. | Liste 1 |
| Hammarbya paludosa (L.) 0. Kuntze. | Malaxis des tourbières. | Liste 1 |
| Hedysarum boutignyanum Alleiz. | Sainfouin de Boutigny. | Liste 1 |
| Helianthemum lavandulaefolium Miller. | Hélianthème à feuilles de lavande. | Liste 1 |
| Helianthemum marifolium (L.) Miller. | Hélianthème à feuilles de Marum. | Liste 1 |
| Helichrysum arenarium Moench. | Immortelle des sables. | Liste 2 |
| Helleborus niger L. | Rose de Noël, Hellébore noir. | Liste 2 |
| Heracleum minimum Lamarck. | Berce naine. | Liste 1 |
| Herniaria latifolia Lapeyr. ssp. litardierei Gamis. | Herniaire de Litardière. | Liste 1 |
| Heteropogon contortus (L.) Beauv. ex Roem. et Schultes. | Herbe barbue, Andropogon. | Liste 1 |
| Hibiscus palustris L. | Ketmie rose des marais. | Liste 1 |
| Hieracium eriophorum Saint Amans. | Épervière des dunes. | Liste 1 |
| Hierochloe odorata (L.) Beauv. | Avoine odorante. | Liste 1 |
| Iberis aurosica Chaix. | Corbeille d'argent du mont Aurouse. | Liste 1 |
| Iberis nana All. = Iberis candolleana Jord. | Corbeille d'argent de De Candolle | Liste 1 |
| Inula bifrons L. | Inule variable. | Liste 1 |
| Inula helenioides DC. | Inule fausse-aunée. | Liste 1 |
| Iris aphylla L. | Iris sans feuille. | Liste 1 |
| Iris sibirica L. | Iris de Sibérie. | Liste 1 |
| Iris tuberosa L. = Hermodactylus tuberosus Miller. | Iris des serpents | Liste 1 |
| Iris xiphium L. | Iris d'Espagne. | Liste 1 |
| Isatis allionii P.W. Ball. | Pastel des Alpes. | Liste 1 |
| Juncus pyrenaeus Timb. Lagr. et Jambernat. | Jonc des Pyrénées. | Liste 1 |
| Jurinea humilis D.C. | Serratule naine. | Liste 1 |
| Kosteletzkya pentacarpos (L.) Ledeb. | Hibiscus à cinq fruits. | Liste 1 |
| Laser trilobum Borkh. | Laser à feuilles à trois lobes. | Liste 1 |
| Lathyrus japonicus subsp. maritimus (L.) P. W. Ball | Gesse de mer | Liste 1 |
| Legousia castellana Sampiao. | Spéculaire de Castille. | Liste 1 |
| Leucanthemum crassifolium (Lange) Willk. | Marguerite à feuilles épaisses. | Liste 1 |
| Leucojum aestivum L. | Nivéole d'été. | Liste 1 |
| Leucoium longifolium Gren. | Nivéole à longues feuilles. | Liste 1 |
| Leucoium nicaeense Ardoino. | Nivéole de Nice. | Liste 1 |
| Leymus arenarius (L.) Hochst. = Elymus arenarius L. | Grand oyat, Seigle de mer | Liste 1 |
| Ligularia sibirica (L.) Cass. | Ligulaire de Sibérie | Liste 1 |
| Limoniastrum monopetalum (L.) Boiss. | Grand statice, Limoniastrum. | Liste 1 |
| Limonium cordatum (L.) Mill. | Statice à feuilles cordées. | Liste 1 |
| Limonium dictyocladum 0. Kuntze. | Statice à rameaux raides. | Liste 1 |
| Limonium diffusum 0. Kuntze. | Statice diffus. | Liste 1 |
| Limonium girardianum Fourr. | Statice de Girard. | Liste 1 |
| Limonium humile Miller. | Petit statice. | Liste 1 |
| Limonium minutum L. s.l. | Statices nains du groupe minutum. | Liste 1 |
| Limonium ramosissimum (Poiret) Mair. ssp. provinciale Pignatti. | Statice de Provence. | Liste 1 |
| Limonium salmonis Pign. | Statice de Salmon. | Liste 1 |
| Linaria cirrhosa (L.) Cav. | Linaire à vrilles. | Liste 1 |
| Linaria commutata Bernh. ex Reichenb. | Linaire grecque. | Liste 1 |
| Linaria flava (Poiret) Desf. | Linaire jaunâtre. | Liste 1 |
| Linaria reflexa (L.) Desf. | Linaire à fruit recourbé. | Liste 1 |
| Linaria thymifolia (Wahl) DC. | Linaire à feuilles de thym. | Liste 1 |
| Lindernia palustris Hartmann = Lindernia procumbens(Krock.) Philcox | Lindernie couchée | Liste 1 |
| Linnaea borealis L. | Linnée boréale. | Liste 1 |
| Liparis loeselii L.C.M. Richard. | Liparis de Loesel. | Liste 1 |
| Lithodora prostata (Loisel.) Griseb. | Gremil à rameaux étalés. | Liste 1 |
| Littorella uniflora (L.) Asch. | Littorelle à une fleur. | Liste 1 |
| Lobelia dortmanna L. | Lobélie de Dortmann. | Liste 1 |
| Loeflingia hispanica L. | Loeflingie d'Espagne. | Liste 1 |
| Lolium parabolicum Sennen ex Sampaio. | Ivraie du Portugal. | Liste 1 |
| Luronium natans (L) Raf. | Flûteau nageant. | Liste 1 |
| Lysimachia ephemerum L. | Lysimaque à feuilles de saule. | Liste 1 |
| Lysimachia europaea (L.) U.Manns & Anderb. | Trientale | Liste 1 |
| Lysimachia thyrsiflora L. | Lysimaque à fleurs en épi | Liste 1 |
| Lythrum thesioides Bied. | Salicaire faux-thésion. | Liste 1 |
| Lythrum thymifolia L. | Salicaire à feuilles de thym. | Liste 1 |
| Lythrum tribracteatum Salzm. ex Sprengel. | Salicaire à trois bractées. | Liste 1 |
|
Malva subovata (DC.) Molero & J.M.Monts. = Lavatera maritima Gouan |
Lavatère d'Espagne | Liste 1 |
| Matthiola tricuspidata R. Br. | Matthiole à fruits à trois cornes | Liste 1 |
| Merendera filifolia Camb. | Mérendère à feuilles filiformes. | Liste 1 |
| Minuartia stricta (Swartz) Hierh. | Sabline dressée. | Liste 1 |
| Moehringia le-brunii Merxmull. | Sabline de Le Brun. | Liste 1 |
| Moehringia provincialis Merxmull. et Grau. | Sabline du Verdon. | Liste 1 |
| Moraea sisyrinchium (L.) Ker Gawl. | Iris faux sisyrhinque | Liste 1 |
| Morisia monanthos (Viv.) Asch. | Morisie | Liste 1 |
| Myosotis pusilla Loisel. | Myosotis ténu. | Liste 1 |
| Myosotis soleirolii Godr. | Myosotis de Soleirol. | Liste 2 |
| Nananthea perpusilla DC. | Nananthée de Corse. | Liste 1 |
| Narcissus triandus L. ssp.capax (Salisb.) L. A. Webb. | Narcisse des Glénan. | Liste 1 |
| Naufraga balearica Constance & Cannon | Naufraga des Baléares. | Liste 1 |
| Nectaroscilla hyacinthoides (L.) Parl. | Scille fausse jacinthe | Liste 1 |
| Nectaroscordum siculum Lindley. | Ail de Sicile. | Liste 1 |
| Nerium oleander L. | Laurier-rose. | Liste 2 |
| Nigella gallica Jordan. | Nigelle de France. | Liste 1 |
| Nonnea pulla DC. | Nonnée brune. | Liste 1 |
| Odontites jaubertiana De Dietr. ex Walpers. | Euphraise de Jaubert | Liste 1 |
| Oenanthe foucaudi Tesseron. | Oenanthe de Foucaud. | Liste 1 |
| Omphalodes littoralis Lehm. | Cynoglosse des dunes. | Liste 1 |
| Ophrys aveyronensis (J.J. Wood) Delforge. | Ophrys de l'Aveyron. | Liste 1 |
| Ophrys bertolonii Moretti s.l. Voir aussi : 2 3 4 5 | Ophrys du groupe bertolonii. | Liste 1 |
| Ophrys bombyliflora Link. | Ophrys bombyx. | Liste 1 |
| Ophrys speculum Link. | Ophrys miroir. | Liste 1 |
| Ophrys tenthredinifera Willd. | Ophrys à grandes fleurs. | Liste 1 |
| Orchis coriophora L. | Orchis punaise. | Liste 1 |
| Orchis longicornu Poiret. | Orchis à long éperon. | Liste 1 |
| Orchis pauciflora Tenore | Orchis à fleurs peu nombreuses. | Liste 1 |
|
Orchis
saccata Tenore = Orchis collina Banks & Solander ex Russel |
Orchis feu, Orchis des collines | Liste 1 |
| Orchis spitzelli Sauter ex Koch. | Orchis de Spitzel. | Liste 1 |
| Paeonia mascula subsp. mascula (L.) Miller | Pivoine coralline, Pivoine mâle. | Liste 2 |
| Paeonia mascula subsp. russoi (Biv.) Cullen & Heywood | Pivoine de Russo | Liste 2 |
| Paeonia officinalis L. | Pivoine officinale, Rose de Notre-Dame. | Liste 2 |
| Pedicularis recutita L. | Pédiculaire tronquée. | Liste 1 |
| Peribalia minuta Aschers et Graebn. | Canche naine. | Liste 1 |
| Phyllodoce coerulea (L.) Bab. | Andromède bleue, Phyllodoce bleue. | Liste 1 |
| Physospermum cornubiense (L.) DC. | Physospermum de Cornouailles. | Liste 1 |
| Phyteuma villarsii R. Schultes. | Raiponce de Villars. | Liste 1 |
| Pimpinella siifolia Leresche. | Pimpinelle à feuilles de Sium. | Liste 1 |
| Piptatherum virescens (Trin.) Boiss. | Millet verdâtre. | Liste 1 |
| Polemonium caeruleum L. | Valériane grecque. | Liste 2 |
| Polygonum raii Bab. | Renouée de Ray. | Liste 1 |
| Potamogeton rutilus Wolfg. | Potamot rougeâtre. | Liste 1 |
| Potentilla delphinensis Gren. & Godron | Potentille du Dauphiné. | Liste 1 |
| Potentilla fruticosa L. | Potentille arbustive. | Liste 1 |
| Primula allionii Loisel | Primevère d'Allioni. | Liste 1 |
| Primula auricula L. | Primevère oreille d'ours. | Liste 1 |
| Primula halleri J.F. Gmelin | Primevère de Haller. | Liste 1 |
| Primula marginata Curtis | Primevère marginée. | Liste 1 |
| Primula pedemontana Gaudin | Primevère du Piémont. | Liste 1 |
| Prunus lusitanica L. | Prunier du Portugal | Liste 1 |
| Pseudorlaya pumila (L.) Grande. | Fausse-Girouille des sables. | Liste 1 |
| Ptilotrichum macrocarpum (DC.) Boiss. | Corbeille d'argent à gros fruits. | Liste 1 |
| Ptilotrichum pyrenaicum Boiss. | Corbeille d'argent des Pyrénées. | Liste 1 |
| Pulicaria vulgaris Gaertn. | Herbe de Saint-Roch | Liste 1 |
| Pulsatilla halleri Willd. | Anémone (Pulsatille) de Haller. | Liste 1 |
|
Pyrola
rotundifolia L. subsp. maritima
(Kenyon) E.F. Warburg |
Pyrole des dunes. | Liste 1 |
| Quercus crenata Lamarck. | Faux chêne-liège. | Liste 1 |
| Ranunculus canuti Cosson. | Bouton d'or de Canut. | Liste 1 |
| Ranunculus fontanus C. Presl. | Renoncule des fontaines. | Liste 1 |
| Ranunculus lateriflorus DC. | Renoncule à fleurs latérales. | Liste 1 |
| Ranunculus lingua L. | Grande Douve. | Liste 1 |
| Ranunculus macrophyllus Desf. | Bouton d'or à grandes feuilles. | Liste 2 |
| Ranunculus millefoliatus Vahl. | Bouton d'or à mille feuilles. | Liste 1 |
| Ranunculus nodiflorus L. | Renoncule à fleurs en boules. | Liste 1 |
| Ranunculus ophioglossifolius Vill. | Renoncule à feuilles d'ophioglosse | Liste 1 |
| Ranunculus revelieri Boreau | Renoncule de Revelière | Liste 1 |
| Reutera lutea Boiss. | Pimpinelle jaune. | Liste 1 |
| Rhaponticum scariosum Lam. | Rhapontique des Alpes | Liste 1 |
| Rhododendron hirsutum L. | Rhododendron poilu. | Liste 1 |
| Rosa gallica L. | Rose de France. | Liste 2 |
| Rouya polygama Coincy. | Thapsie de Rouy. | Liste 1 |
| Rumex rupestris Le Gall. | Oseille des rochers. | Liste 1 |
| Rumex tuberosus L. | Oseille tubéreuse. | Liste 1 |
| Salix breviserrata B. Flod. | Saule à feuilles de myrte. | Liste 1 |
| Salix helvetica Vill. | Saule de Suisse. | Liste 2 |
| Salix lapponum L. | Saule des Lapons. | Liste 1 |
| Saponaria bellidifolia Sm. | Saponaire à feuilles de pâquerette. | Liste 1 |
| Saponaria lutea L. | Saponaire jaune. | Liste 1 |
| Saxifraga florulenta Moretti, | Saxifrage à nombreuses fleurs. | Liste 1 |
| Saxifraga hieraciifolia Walds. et Kit. | Saxifrage à feuille d'épervière. | Liste 1 |
| Saxifraga hirculus L. | Saxifrage oeil de bouc | Liste 1 |
| Saxifraga museoides All. | Saxifrage fausse-mousse. | Liste 1 |
| Saxifraga mutata L. | Saxifrage variable. | Liste 1 |
| Saxifraga valdensis DC, | Saxifrage de Vaud. | Liste 1 |
| Scandicium stellatum Thellung. | Scandix étoilé. | Liste 1 |
| Scheuchzeria palustris L. | Scheuchzérie des tourbières. | Liste 1 |
| Schoenus ferrugineus L. | Choin ferrugineux | Liste 1 |
| Scirpus pumilus Vahl. | Scirpe alpin | Liste 1 |
| Scorzonera parviflora Jacq, | Scorzonère à petites fleurs. | Liste 1 |
| Scrophularia pyrenaica Bentham. | Scrofulaire des Pyrénées. | Liste 1 |
| Sedum andegavense Desv. | Vermiculaire d'Angers. | Liste 1 |
| Senecio bayonnensis Boiss. | Séneçon de Bayonne. | Liste 1 |
| Senecio congestus (R. Br.) DC. | Cinéraire des marais. | Liste 1 |
| Senecio macrochaetus Willk. | Séneçon à grosses soies. | Liste 1 |
| Senecio rutheniensis Maz. Timb. | Sénéçon du Rouergue. | Liste 2 |
| Serapias neglecta De Not. | Sérapias négligé. | Liste 1 |
| Serapias nurrica B. Corrias | Sérapias des nuraghi. | Liste 1 |
| Serapias parviflora Parlat. | Sérapias à petites fleurs. | Liste 1 |
| Serratula lycopiifolia A. Kerner. | Serratule à feuilles de chanvre d'eau. | Liste 1 |
| Seseli boconii Guss. | Seseli de Bocone. | Liste 1 |
| Silene coeli-rosa (L.) Godron | Silène d'un rose céleste. | Liste 1 |
| Silene salzmanii Badaro ex Moretti. | Silène de Salzmann. | Liste 1 |
| Silene velutina Pourret ex Loisel. | Silène velouté. | Liste 1 |
| Sisymbrium supinum L. | Sisymbre couché. | Liste 1 |
| Soldanella villosa Darracq | Grande Soldanelle | Liste 1 |
| Sorbus latifolia Persoon. | Alisier de Fontainebleau. | Liste 1 |
| Spiranthes aestivalis L. C. M. Richard. | Spiranthe d'été. | Liste 1 |
| Stachys brachyclada De Noë ex Cosson. | Épiaire à rameaux courts | Liste 1 |
| Stachys ocymastrum (L.) Briq. | Épiaire hérissée | Liste 1 |
| Stenbergia colchiciflora Waldst. et Kit. | Stenbergie à fleurs de colchique. | Liste 1 |
| Suchowia balearica (L.) Médie. | Suckowia. | Liste 1 |
| Tamarix africana Poiret, | Tamaris d'Afrique. | Liste 1 |
| Teline linifolia (L.) Webb. et Berthelot. | Genêt à feuilles de lin. | Liste 1 |
| Teucrium asistatum Perez Lara. | Germandrée de Crau. | Liste 1 |
| Teucrium fruticans L. | Germandrée arbustive. | Liste 1 |
| Teucrium massiliense L. | Germandrée de Marseille. | Liste 1 |
| Teucrium pseudochamaepitys L. | Germandrée à allure de pin | Liste 1 |
| Thorella verticillatinundata (Thore) Briquet. | Thorella, Faux-Cresson de Thore. | Liste 1 |
| Thymelaea ruizii Loscos ex Casav. | Passerine de Ruiz. | Liste 1 |
| Thymelaea tartonraira (L.) All. | Tartonraire. | Liste 1 |
| Thymelaea thomasii Duby. | Passerine de Thomas. | Liste 1 |
| Tofieldia pusilla (Michx.) Pers. | Tofieldie boréale. | Liste 1 |
| Trifolium cernuum Brot. | Trèfle à fleurs penchées. | Liste 1 |
| Trifolium saxatile All. | Trèfle des rochers. | Liste 1 |
| Triglochin laxiflorum Guss. | Troscart à fleurs lâches. | Liste 1 |
| Tulipa agenensis DC. | Tulipe oeil de soleil. | Liste 1 |
| Tulipa clusiana DC. | Tulipe de de l'Écluse. | Liste 1 |
| Tulipa gesneriana L. | Tulipes de Gesner. | Liste 1 |
| Tulipa praecox Ten. | Tulipe précoce. | Liste 1 |
| Tulipa sylvestris L. subsp. sylvestris | Tulipe des bois, Tulipe sauvage | Liste 1 |
| Typha minima Funk | Petite massette. | Liste 1 |
| Typha shuttleworthii Koch et Sondes | Massette de Shuttleworth. | Liste 1 |
| Urginea fugax Steinh. | Scille éphémère | Liste 1 |
| Utricularia ochroleuca R. Hartmann | Utriculaire d'un vert jaunâtre. | Liste 1 |
| Valeriana celtica L. | Nard celtique. | Liste 2 |
| Veratrum nigrum L. | Vératre noir. | Liste 1 |
| Vicia altissima Desf. | Vesce élevée. | Liste 1 |
| Vicia argentea Lapeyr. | Vesce argentée. | Liste 1 |
| Vicia barbazitae Ten, ex Guss. | Vesce de Barbazita. | Liste 1 |
| Viola arborescens L. | Violette sous-arbustive. | Liste 1 |
| Viola cryana Grillot | Violette de Cry. | Liste 1 |
| Viola elatior Fries. | Violette élevée | Liste 1 |
| Viola pinnata L. | Violette à feuilles pennées | Liste 1 |
| Viola rothomagensis Lamarck | Pensée de Rouen | Liste 1 |
| Viola tricolor subsp. curtisii (E.Forst.) Syme = Viola curtisii E. Forst. | Pensée de Curtis, Pensée des dunes | Liste 2 |
| Vitex agnus-castus L. | Gattilier | Liste 2 |
| Vitis vinifera ssp. sylvestris (C.C. Gmelin) Hegi | Lambrusque, vigne sauvage | Liste 1 |
| Xatardia scabra (Lapeyr.) Meissn. | Xatardie, Persil d'isards | Liste 1 |
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Gymnospermes |
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| Pinus mugo Turra | Pin mugo, Pin mugho, Pin des montagnes. | Liste 1 |
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Ptéridophytes |
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| Asplenium cuneifolium Viv. | Doradille à feuilles en coin | Liste 1 |
| Asplenium fissum Kit et Willd. | Doradille du Mercantour | Liste 1 |
| Asplenium jahandiezii (Litard.) Rouy | Doradille du Verdon | Liste 1 |
| Asplenium lepidum C. Presl. | Doradille pulvérulente | Liste 1 |
| Asplenium sagittatum (DC.) Bange | Doradille sagittée | Liste 1 |
| Asplenium seelosii Leybold. | Doradille de Seelos. | Liste 1 |
| Botrychium lanceolatum (S.G.Gmel.) Ångstr. | Botryche à feuilles lancéolées | Liste 1 |
| Botrychium matricariifolium (A.Braun ex Döll) W.D.J.Koch | Botryche à feuilles de Matricaire | Liste 1 |
| Botrychium multifidum Ruprecht. | Botrychium à feuilles multifides. | Liste 1 |
| Botrychium simplex E. Hitchc. | Botryche simple | Liste 1 |
| Cosentinia vellea (Aiton) Tod. subsp. bivalens | Doradille laineuse | Liste 1 |
| Cystopteris diaphana (Bory) Blasdell | Cystoptéris diaphane, Asplénium vert | Liste 1 |
| Cystopteris montana (Lam.) Desv. | Cystoptéris des montagnes. | Liste 1 |
| Diphasiastrum alpinum (L.) Holub. | Lycopode des Alpes. | Liste 1 |
| Diphasiastrum complanatum (L.) Holub. | Lycopode aplati | Liste 1 |
| Diphasiastrum issleri (Rouy) Holub | Lycopode d'Issler | Liste 1 |
| Diphasiastrum tristachyum (Pursh) Holub | Lycopode petit-cyprès. | Liste 1 |
| Diphasiastrum zeilleri (Rouy) Holub | Lycopode de Zeiller | Liste 1 |
| Dryopteris aemula (Aiton) Kuntze | Dryoptéris atlantique | Liste 1 |
| Dryopteris cristata A. Gray. | Dryoptéris à crêtes | Liste 1 |
| Dryopteris pallida (Bory) Maire & Petitm. | Dryoptéris pâle | Liste 1 |
| Dryopteris tyrrhena Fraser-Jenkins | Dryoptéris tyrrhénien | Liste 1 |
| Hymenophyllum tunbrigense (L.) Sm. | Hyménophylle de Tunbridge | Liste 1 |
| Hymenophyllum wilsonii Hook. | Hyménophylle de Wilson | Liste 1 |
| Isoetes boryana Durieu | Isoète de Bory. | Liste 1 |
| Isoetes durieui Bory | Isoète de Durieu | Liste 1 |
| Isoetes echinospora Durieu | Isoète à spores spinuleuses. | Liste 1 |
| Isoetes hystrix Bory | Isoète épineux. | Liste 1 |
| Isoetes lacustris L. | Isoète des lacs | Liste 1 |
| Isoetes setacea Lam. | Isoète grêle | Liste 1 |
| Isoetes velata A. Braun | Isoète voilé | Liste 1 |
| Lycopodiella inundata (L.) C. Börner. | Lycopode des tourbières | Liste 1 |
| Marsilea quadrifolia L. | Fougère d'eau à quatre feuilles | Liste 1 |
| Marsilea strigosa Willd. | Fougère d'eau à poils rudes | Liste 1 |
| Matteuccia struthiopteris (L.) Todaro | Matteucie, Fougère d'Allemagne | Liste 1 |
| Ophioglossum azoricum C. Presl | Ophioglosse des Açores | Liste 1 |
| Pilularia globulifera L. | Pilulaire, Pilulaire à globules | Liste 1 |
| Pilularia minuta Durieu ex A. Braun. | Pilulaire délicate. | Liste 1 |
| Polystichum braunii (Spenn.) Fée | Polystic de Braun | Liste 1 |
| Salvinia natans (L.) All. | Salvinia nageante. | Liste 1 |
| Stegnogramma pozoi (Lag.) K. Iwats. | Stegnogramma de Pozo | Liste 1 |
| Trichomanes speciosum Willd. | Trichomanès remarquable | Liste 1 |
| Woodsia ilvensis (L.) R.Br. | Woodsia d'Elbe | Liste 1 |
| Woodwardia radicans (L.) Sm. | Woodwardia radicant | Liste 1 |
